污染分析细菌微生物的污染初期阶段并不明显，一旦明显就非常难以控制。当进水隔网的开放空间被生物滋长污染后，就破坏了产生湍流的机制。湍流的减弱使得颗粒和其他悬浮物质沉淀并在生物膜基质上积累，从而引起污染，在这种情况下RO系统会造成不可恢复的污染。一旦生物膜形成，它就会通过细菌基质吸收和富集周边的有机物和无机养分来自我维持。亦会吞噬膜材料，形成致密的生物膜。因此有效的控制微生物杀死细菌并使之清理出膜表面非常重要
解决方法1、细菌污染一旦发展到一定的阶段会有个爆发过程，一旦爆发就很难进行控制和清除，只能更换膜元件，损失惨重，所以微生物污染必须得到充分的重视。定期投加膜专用非氧化性杀菌剂，防范于未然。
2、对于已经被污染的RO系统，用高浓度的膜专用非氧化性杀菌剂清洗膜系统，同时清洗所有管线，离线化学清洗加杀菌清洗非常有必要。
